Las actividades del hombre, tales como la agricultura, ganadería, pesca, la producción artesanal y la urbanización, han tenido un impacto negativo sobre el lago de Pátzcuaro.

Algunas de estas actividades son responsables de aportes contaminantes al lago como son los deshechos químicos y las aguas negras; mientras que otras ejercen una fuerte presión sobre la disponibilidad de recursos naturales de la región, tales como la pesca y la producción de artesanías.

Otra de las problemáticas del lago es la erosión, causada no sólo por la naturaleza sino por las actividades que realiza el hombre a sus orillas.